SMP Islam An-Nawawiyyah merupakan sekolah yang menggunakan kurikulum 2013 dan kurikulum 2006. Kurikulum 2013 untuk kelas 7 dan 8 dan kurikulum 2006 untuk kelas 9. Adapun muatan mata pelajaran yang ada di sekolah SMP Islam An-Nawawiyyah pada umumnya sama seperti kebanyakan sekolah di Rembang yaitu, PAI/PABP, PPKn, Bahasa Indonesia, Bahasa Inggris, Matematika, IPA, IPS, Seni Budaya, Penjasorkes, Prakarya, TIK dan muatan local Bahasa Jawa. Namun ada beberapa muatan khas dari SMP Islam An-Nawawiyyah. Bahasa Arab, bahasa arab merupakan suatu mata pelajaran yang diarahkan untuk mendorong, membimbing, mengembangkan, dan membina kemampuan serta menumbuhkan sikap positif terhadap bahasa arab baik reseptif maupun produktif. Kemampuan reseptif yaitu kemampuan untuk memahami pembicaraan orang lain dan memahami bacaan. Kemampuan produktif yaitu kemampuan menggunakan bahasa sebagai alat komunikasi baik lisan maupun tulis. Tujuan dari mata pelajaran ini adalah mengembangkan kemempuan berkomunikasi dalam bahasa arab, baik lisan maupun tulis, yang mencakup empat cakupan berbahasa, yakni menyimak (istimwa’), berbicara (kalam), membaca (qiro’ah) dan menulis ( kitibah), menumbuhkan kesadaran tentang pentingnya bahasa Arab sebagai slah satu bahasa asing untuk menjadi alat utama belajar, khususnya dalam mengkaji sumber sumber ajaran islam dan mengembangkan pemahaman tentang salaing keterkaitan antara bahasa dan budaya serta memperluas cakrawala. Dengan demikian peserta didik diharapkan memiliki wawasan lintas budaya dan melibatkan diri dalam keragaman budaya.
Selain bahasa Arab, muatan lokal yang menjadi kekhasan SMP Islam An-Nawawiyyah adalah
- Program Takhasus Tahfidzul Qur’an
Program ini telah mulai dari awal tahun pelajaran 2018/2019 dengan peserta didik pilihan yang berminat dan mampu memenuhi target tahfidzul qur’an. Target program Tahfidzul Qur’an di SMP Islam An-Nawawiyyah, dapat menghafal Al-Qur’an 1 Juz dalam 3 bulan. Dengan demikian selama menempuh pendidikan di SMP Islam An-Nawawiyyah dapat menghafal 12 Juz Al-Qur’an. Pelaksanaannya di waktu jam pertama sampai ke tiga setiap harinya.
- Sekolah Vokasi
Sekolah vokasi ini merupakan program dari BLKK yang diberikan kepada peserta didik SMP Islam An-Nawawiyyah selama 3 tahun belajar. Pelaksanaannya dilakukan pada waktu minggu tidak efektif, misalnya masa jeda, libur semester dan libur kenaikan kelas.
